
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱怪物 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
钻研报告单
科学研究人员管理探究性学习跟随着冷冻周期延后牛羊肉的密度、持水力发电、色度、徘徊铁横向、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4横向来评价指标健身肌肉安排人体人体细胞的铁阵亡睡眠状态。毕竟体现 ,冷冻周期延后后,牛羊肉的密度在第5天和第6天可观越来越低;持水工作能力较低;颜色图片变深,得不到金属光泽,鲜红白色转成暗红白色。还有就是,徘徊铁、活力性氧和MDA的横向可观不断增加,人体人体细胞凋亡率可观增高。 研发工作员分离出来有所各种冷冻周期的肌肤仿品的膳食纤维质,最后开始SDS-PAGE进行分析一下,膳食纤维质条带在有所各种时匀称透亮且相类似(图1a)。依照膳食纤维在有所各种仿品中的展示实际情况,进行分析一下发觉同时组仿品的中四位数贴近于同时能力(图1b),表明肌肤仿品膳食纤维质都具有更好的组内相类似性和组间相互影响性。 球蛋清质酶质含量组学共监定出1996种球蛋清质酶质含量。以B0为较组,选择B1、B2、B4和B6中的球蛋清质酶进行文化之间的关系展示定性了解,共监定到375个DEPs。将火山图可视化管理,并给出FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两人标淮定性了解DEP。但是长为1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别监定出22、33、73和140个DEPs,表中别上浮6、11、32和8九个,调整16、22、41和51个。聚类算法办法评价指标了不一样的速冻关键期肌群组识中球蛋清质酶质含量的展示,但是彰显肌群球蛋清质酶展示文化之间的关系随着时长推移补充时长的上升而上升(图1g)。
图1| 其他食品冷藏日期的相关肌肉检样核胆固醇组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同的速冻日子的手臂肌肉样本区别蛋清进行分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁阵亡蛋白酶肽的PRM酶联免疫法定量分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 针对KEGG生物富集区别表达爱蛋清的铁生亡体系(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱工作小结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱菌物提供了TMT一定量淀粉酶质组学技艺服务项目于,拜谱生物工程已科研成功完成并设立了健全完善完善的转录组学、淀粉酶组学、细胞代谢组学甚至多个学协同企业产品技艺服务项目于采集体系,欢迎致电咨询!
参考价值学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.