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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已表示出密切的菌物活性氧，涉及到抗肺部肿瘤和抵抗毒效果。基本，三萜是确认甲羟戊酸手段自动合成的，并从具有绿植和白色念珠菌中分离出来。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊出了一篇“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的深入分析文献综述。该深入分析显示三萜类类化合物虫草酸（GA）是能够液态物质培训的无柄虫草菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的菌物体转成存在的。会按照转录组和球膳食纤维组学枝术进步科学探索无柄虫草菌丝体中DHT存在三种虫草酸（GA）的规则，并会按照几组学枝术检验到的相互影响dna和相互影响球球蛋白，预测DHT 菌物体自动合成 GA 的路线。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录酚类化合物析和系统等级分类

用对无柄灵芝粉真菌感染菌丝体参与转录组测序共能够 67230个转录本和14299个单DNA。在这一些单DNA中，498个被司法鉴定为差距传达DNA（DEGs），各举213个传达调涨，279个传达下跌（图1A）。GO聚集进行深入分析后，DEGs可分为生物技术环节（BP）、神经组织细胞组成（CC）和团伙功效（MF）3类。在BP类目中，发生了前六个子类目：抗菌素拆分产生环节，冰醋酸盐产生环节和甲酸盐产生环节;而在CC类目中，神经组织细胞外区、突触黏结体、突触机构是前六个亚类。而言MF类目，甲酸脱氢酶（NAD）抗逆性、氧化物抹除酶抗逆性和酸氨（或酰胺）接酶抗逆性是前六个亚类目（图1B）。在DEGs的KEGG通道进行深入分析中，前30条聚集度较高的通道有27条是一种产生，各举丁烷产生、乙醛酸盐和二羧酸盐产生、丙酸盐产生讯号通道强势聚集（图1D）。

图1|转录多组分析和工作划分类别

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

用对无柄灵芝粉病菌菌丝体判断脂肪酸质组学解析，总计判断了16,457种多样肽、2606种脂肪酸质和2588种参考值脂肪酸质。在阀值|FC|>1.2和p<0.05的选择状况下，在这儿2606种脂肪酸质中，94种被鉴定费为距离形容脂肪酸（DEPs），之中52种调整，42种调整（图2A），图2C屏幕上屏幕上展示了距离形容脂肪酸的聚类数据信息概述解析热图。从GO解析而言，BP门类屏幕上屏幕上展示，大部分数DEPs去醋酸钠盐基础产生流程、抗菌药可分解掉基础产生流程和药物剂量可分解掉基础产生流程。CC类DEPs在神经元外区、过钝化物酶体和微体中总额最快，钝化备份酶特异性和甲酸脱氢酶（NAD）特异性在MF类中DEPs的分配比例最快（图2B）。与转录组结局相仿，KEGG径路解析屏幕上屏幕上展示，不少DEPs在基础产生中菌物丰度，之中3条最菌物丰度的条件是光合菌物中的碳稳定、碳基础产生和MAPK手机信号径路（图2D）。除外，用解析GO数据信息库的CC对DEPs判断亚神经元角度解析和注解（图2E），DEPs基本分布图制作在神经元质（40.66%）、神经元膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），认识论上是GAs菌物组成的基本角度。

图2|核营养物质组的化学发光法分折和能力手机验证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

谋生物图片转换和對照组得票数DEGs和DEPs定制了维恩图，有20个差距表示表观遗传遗传（图3A）。对转录组和膳食纤维质组中E组和C组共要的DEGs/DEPs使用聚类研究研究，挖掘mRNA和膳食纤维质两者有1五个上涨表观遗传遗传和五个变动表观遗传遗传，DEGs与之汉语翻译的DEPs表示标准呈正有关的，应用场景Pearson的有关的比率研究，在转录组和膳食纤维质组两者在线检测到比较较高的有关的性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）测试最终出现，E组和C组115个DEGs的表答层次之间的关系明显，在当中9个为调整DEGs，1个为再降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的表答市场需求与转录成分析最终同样。

图3|蛋白酶质组的酶联免疫法解析和特点校验

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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