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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设计里普通的病症中的一种。肾聚集中CaOx氯化钠晶体过过饱和积累会引致肾小管神经元软组织损伤和凋亡,最后引致肾结石的形成了。短链皮下皮脂酸由肠胃内厌氧反应器沙门氏菌沤肥饮食纤维材料发生,除了在高斯模糊肠胃天然屏障中表现用,特别在设计技术上也表现关健用。中间,丁酸是最丰厚的短链皮下皮脂酸,有抗感染和免疫系统阻止用,本论述浅析丁酸对CaOx肾结石的用名词解释潜在性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院专家泌尿急诊科吴忠教受、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健医生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网洛药学学服务保障,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子称呼:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 投资者企事业单位:华山宠物医院 调查因素:大鼠、HK-2血细胞 排列讯息:剖析组(Con)、类别组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提高技术应用:线上临床药理学检侧

设想方案图

探索的结果

科学学习成员第一个构造 大鼠整治,就能够通过生理学生化学技术指标和安排病理报告学复染等科学学习伎俩察觉丁酸就能够限制CaOx整治大鼠肾CaOx单晶体的构成和挫伤,有所改善CaOx整治大鼠的发炎挫伤和空气腐蚀东西的过重形容。不仅,丁酸还可减弱草酸诱导性的HK-2人体内部挫伤、空气腐蚀应激状态和人体内部凋亡。 为科学探究丁酸设计和靶人类什么是遗传遗传DNA遗传微信系统,钻研职工从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和二维设计(图1A)。经过PharmMapper动态数据统计表格库系统和Uniprot动态数据统计表格库系统治理后共选择出119个丁酸靶人类什么是遗传遗传DNA遗传供进一次定性深入剖析。将人类什么是遗传遗传DNA遗传数据统计库导到STRING动态数据统计表格库系统,实施PPI微信系统定性深入剖析。Cytoscape得到了排列的前20的核心靶人类什么是遗传遗传DNA遗传的完整微信系统图,涉及到CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这个核心人类什么是遗传遗传DNA遗传与微信系统中的其余人类什么是遗传遗传DNA遗传均表达出一定的的有关于系性,这说明这个人类什么是遗传遗传DNA遗传可以引领着信息化影响。GO和KEGG定性深入剖析呈现了丁酸核心人类什么是遗传遗传DNA遗传的有关于系路径和微植物学功效(图1C)。核心人类什么是遗传遗传DNA遗传其主要是与类固醇的肾上腺素回复、防钝化应激状态反馈回复、吸附性氧上皮细胞对类固醇的肾上腺素有趣的反馈并且 对弱酸性无机化学元素的反馈有关于。综上说明说明,这个核心人类什么是遗传遗传DNA遗传其主要是参于了防钝化应激状态反馈和对吸附性氧的微生态学反馈进程,是肾结石型成长效机制中至关非常更重要的路径,这显示丁酸可以在肾结石中引领非常更重要影响。

图1| 丁酸结构的与靶什么是基因在线概述(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步深入科研丁酸对CaOx肾结石那就是切靶DNA,科研相应的人士再生利用GEO的数据表格库显视对GSE73680中正常差表与CaOx肾结石用户的DNA之间目的去了科研。差表组与CaOx结石用户的特殊性之间目的表述DNA(DEGs)什么是什么是染色体遗传检测标为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个DNA会出现特殊改变,这里面3379个(89.4%)DNA表述调整,404个(10.6%)DNA表述上涨(图2A)。对DEGs去聚类分析法深入分析法深入分析,热图显视了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析法深入分析法特色(图2B)。最后,科研相应的人士依据GeneCards的数据表格库显视人力评定了370个可能性与CaOx肾结石相应的的DNA,名次前20位的預测DNA简述相应的性评分表就像文中2C如图。为着寻找到丁酸治疗方法CaOx肾结石的至关重要靶点,科研相应的人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相应的DNA净化处理得以好几回个Venn图。终结,CYP2C9被来确定为丁酸目的CaOx肾结石的不确定靶点(图2D)。虽然,科研相应的人士还去了丁酸与CYP2C9的团伙衔接,CYP2C9的5个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸之间目的,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在灵活运用网络上临床药理学推测CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶表观遗传后,调查技术人员还能够内部实验室证明了CYP2C9可变低草酸诱导型的HK-2内部的ROS质量、炎症病变伤害和凋亡。

图2| 多半据库综合进行分析预侧CYP2C9是丁酸效应于CaOx肾结石的靶什么是基因

研究方案后果

本学习1感觉丁酸在身体外和体中均能缓和CaOx肾结石模式的防氧化物应激反应性和发炎挫伤,那么实现系统药学学挑选有丁酸的影响CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,在最后实现生殖細胞测试查证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2生殖細胞ROS品质、发炎挫伤和凋亡。这感觉阐明丁酸可能实现缓和CYP2C9来缓和CaOx肾结石的防氧化物应激反应性,解决发炎挫伤。这些的时候中拜谱生物制品水平带来了了系统药学学水平服务的的,除外拜谱生物制品水平可改善成熟稳定健全完善的表观遗传组学、蛋白酶质组学、产生组学等几组学新产品及水平服务的的,祝贺转达网络咨询! 参考使用期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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