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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 新品发布消息会发布消息|乳过酸的逆襲哥哥,衣康过酸呈现血清组脾气不好来战!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直都在用作精细化工辅料而被列举的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“代谢率有害垃圾”将成为“宝藏地图小原子”的心酸经历似的,昨天近三十年才被表明其主要的微生态学功能表,此后“侧睡农奴把合唱”,专门是在免疫性细菌感染性重大常见疾病学习域内异军突起。已经存在几篇职称论文有关报道了在所有细菌感染性重大常见疾病的家禽模式中争取衣康酸或其物理化学修饰语衍微生物的治療益处,并表明其隐藏的靶点。对於衣康酸的“上辈子”与“今身”,具体情况见文案《乳酸的逆袭女神兄妹——衣康酸!这篇文章跟大家熟知 衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用体现淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度遮盖位点检测,稳定可靠重演经典爱情靶点,全坐向生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“会发现”到“核实”全步骤保障,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、工作过程

02、试验数据文件

03、经“点”再次出现

在亲测数据表格中,排除多条学术论文中简讯的金典靶点和衣康酸装饰位点,如首先个被显示的衣康酸共价装饰血清酶KEAP1,另外还有糖酵解径路中的3个重要的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体包含血清酶NLRP3和细胞系损伤步骤中的重要的血清酶RIPK3等,其质谱图方式图提示。

04、车辆作用

1.多大质控

商务化非特异朋友电极孵育、SDS-PAGE在线查重、WB手机验证、样表涉及到性定性分析等供需双坐向在线查重,为了保证创业项目导致靠得住性。

2.高能力质谱设备系统

在Orbitrap Astral全第七代名将高鉴别质谱仪带动下,改变衣康硝化作用呈现位点及淀粉酶签定新深度的,助推科学课探索新发觉。

3.全过程一趟式功能

研究背景拜谱海洋生物逐步完善的科学试验品台,可带来了“体细胞致力于→测试探针孵育→WB测量→什么难以理解的度衣康过酸突显测量→专属密码生信研究分析→既定位点PRM认证”全方案服務,省时保持平衡更安心省心。

05、解析资源(组成部分)

06、APP目标方向

PART 2、期刊论文分享视频

资料一

国外英文名称:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文翻译问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

分析介绍:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

学术论文二

国外英文题头:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版一级标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

实验信息内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、成功案例繁衍想法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13还具有过强的底物综合能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康酸性反应表达组试验数据统计中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸绘制(如下所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱工作小结

用作TCA循环法中的在期间细胞新陈细胞代谢物,衣康酸自动调节细胞新陈细胞代谢、免疫抗体细胞细胞和急病两者的完美效果,为制疗免疫抗体细胞细胞急病性急病出示了取代制疗攻略。衣康酸架构中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸架构能对球膳食纤维含量质上的可溶性半胱氨酸残基开始烷基化掩盖(迈克尔增益发生反应),某一讲述后掩盖被称之为“衣康酸掩盖(itaconation)”,接着影向球膳食纤维含量质基本功能,自我调节免疫抗体细胞细胞初次应答和细胞新陈细胞代谢前提条件,为多重急病用量科研开发出示新难点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应修饰语核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物药学绝一定量靶向药物新陈代谢组(QMT1000)或能量是什么基础细胞代谢靶向疗法基础细胞代谢组食品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考使用医学文献

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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